27 сентября 2012 года Михаил Бабич в Нижнем Новгороде на заседании президиума Коллегии по вопросам безопасности при полномочном представителе Президента России в ПФО обсудил меры по противодействию религиозному экстремизму и терроризму в регионах Приволжья.Как пояснил Михаил Бабич: «Мы обсуждали комплекс мер, которые должны приниматься органами государственной власти на федеральном и региональном уровнях, правоохранительным блоком, надзорными структурами по противодействию религиозному экстремизму и признакам терроризма, которые, к сожалению, сегодня в разных регионах нашего округа имеют тенденцию к росту». Михаил Бабич заявил: «Мы готовим комплекс предложений, который будет вынесен на Совет по безопасности, на одном из заседаний которого предполагается обсудить тот комплекс мер, который необходимо принять для решения вопросов по формированию соответствующего законодательства, исходя из сложившейся практики, из развития материально-технической базы, кадрового наполнения и специфики работы правоохранительного блока. Каждая структура сегодня внесла конкретные предложения, они будут обобщены и в виде решения оформлены для доклада Президенту России».
На вопрос журналистов о том, насколько жесткие меры будут предприняты, Михаил Бабич пояснил: «Эти меры должны быть не жесткими, а обоснованными, профессиональными и должны решать стоящие сегодня проблемы и отвечать тем вызовам, которые сложились. Сегодня есть рост исламизации в различных регионах округа, а именно нетрадиционных исламских течений. Это салафиты, ваххабиты, выходцы из республик Центральной и Средней Азии, которые нелегально прибывают на территорию российских регионов и навязывают свои правила игры: начинают учить молиться, исполнять обряды, устанавливают правила взаимоотношений. Дальше это сопровождается соответствующей литературой, поражением умов, прежде всего молодежи, оттоком молодых людей за рубеж для обучения. Мы должны создавать условия для обучения на своей территории, и для этого есть все возможности. А дальше идет распространение радикальных исламских течений, которые потом, к сожалению, имеют тенденцию перерастать в экстремистские действия и террористические акты».
Говоря о важности исламского образования, Михаил Бабич отметил: «В Уфе мы с муфтиями достаточно подробно обсуждали эту тему, а сейчас с правоохранителями говорили о том, что важнейшая государственная функция – обеспечить полноценное исламское образование, подготовить кадры, создать условия, когда получив образование, молодые люди смогли служить в мечетях. Кроме вопросов образования, это, безусловно, пресечение каналов финансирования незаконных организаций, пресечение незаконных каналов миграции, наркотрафика, - все сопутствующие проблемы, которые сегодня создают финансовую и интеллектуальную базу для радикальных течений».
Полномочный представитель Президента напомнил, что обсуждение мер по противодействию религиозному экстремизму не первое: «В этом году мы дважды проводили Советы муфтиев, отдельно встречались с представителями правоохранительных структур в Самаре, сегодня провели Коллегию по безопасности, а завтра в Саратове состоится Совет округа по миграционной тематике. Это всё сопряженные вопросы».
В состав президиума Коллегии входят руководители окружных управлений МВД, ФСБ, МЧС, Минюста, Росфинмонторинга, федеральных служб исполнения наказаний и по контролю за оборотом наркотиков, Следственного управления СК России и Следственного комитета РФ на транспорте, Генеральной прокуратуры России, а также заместитель полномочного представителя Президента РФ в ПФО - заместитель председателя Коллегии Алексей Сухов, помощник полпреда Александр Дрожжин, начальник департамента по вопросам правоохранительной деятельности, обороны и безопасности аппарата приволжского полпреда - ответственный секретарь Коллегии Алексей Галкин.